RESUMO: 0 trabalho analisa as alternativas para a superação dos entraves interpostos pela Administração Direta ao avanço institucional da pesquisa agropecuária paulista. Parte da premissa básica de que é fundamental a unicidade organizacional para fazer frente à necessidade de integração com vistas a uma atuação interativa característica de uma programação dentro da visão de sistemas. Finalmente, apresenta a autarquia especial, organizada com uma estrutura matricial balanceada, como a mais ideal, em face das características da pesquisa agropecuária paulista, constituída de institutos consolidados. Tal alternativa promoveria a possibilidade de modernização institucional com o aproveitamento dos recursos e da infra-estrutura existentes.